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dna甲基化异常与系统性红斑狼疮病研究

2018-10-27 13:44| 发布者: 朱超| 查看: 211| 评论: 1

简介:DNA甲基化异常与系统性红斑狼疮研究目的研究方法研究结果 系统性红斑狼疮(SLE)是一种慢性的系统性自身免疫性疾病,DNA序列完全一致的同卵双胞胎对SLE的易感性是不同的它们同患SLE的一同概率仅为39%-60%,这可能与DN ...


1DNA甲基化异常与系统性红斑狼疮

    系统性红斑狼疮(SLE)是一种慢性的系统性自身免疫性疾病,DNA序列完全一致的同卵双胞胎对SLE的易感性是不同的它们同患SLE的一同概率仅为39%-60%,这可能与DNA合成后修饰在基因表达调控中的作用是相关的其中DNA甲基化异常在SLE发病中引起的作用越来越受到关注到现在已经证实异常DNA甲基化通过调控一系列SLE相关基因的表达从而导致了系统性红斑狼疮SLE的发产生,目前已发现的基因包括穿孔素基因、CD70、LFA-1等。

dna甲基化异常与系统性红斑狼疮病研究63 作者: 来源:

    最新研究结果详见下文:

2研究目的

    SLE是一种慢性自身免疫性疾病,其临床表现具有异质性且病状多种多样越来越多人认为DNA甲基化改变参与SLE的发病本研究分析了大量SLE患者和健康人群的DNA甲基化特征主要为了探索发现新的SLE表观遗传学改变并研究其与SLE遗传风险之间的关系。

dna甲基化异常与系统性红斑狼疮病研究21 作者: 来源:

3研究方法

    从548例SLE患者和587例健康对照者的血液标本中提取DNA,采用IIIumina公司生产的人甲基化450k芯片对DNA标本进行分析,该芯片可靶向整个基因组的485000个CpG位点。将来自相同个体的采用IIIumina公司生产的免疫芯片进行分析得到的196524个单核甘酸多态性基因型数据进行甲基化数量性状位点分析。

dna甲基化异常与系统性红斑狼疮病研究95 作者: 来源:

4研究结果

    我们在SLE患者基因组7245个CpG位点中识别并复制了不同的甲基化CpG位点。最大的甲基化差异出现在I型干扰素调节的基因中这些基因在SLE患者中表现为甲基化降低我们绘制了顺式甲基化数量性状位点图谱并从中鉴定出SLE患者466个不同甲基化程度的CpG位点甲基化水平的遗传调控SLE的遗传相关性分析丰富了采用甲基化数量性状位点分析方法分析得到的不同甲基化CpG位点的意义,包括几个SLE全基因组关联研究位点:PTPR,CMHC-classIII、UHRF1BP1、IRF5、IRF7、IKZF3,我们还发现SLE患者20个不同甲基化程度CpG位点的甲基化水平差异与基因型存在关联,包括HLA-DQB2位点。SLE的几种遗传风险变异可能是通过改变靶基因调控区域的DNA甲基化水平从而对表型产生影响。

dna甲基化异常与系统性红斑狼疮病研究11 作者: 来源:


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  • 引用 JanPholo 2020-3-31 07:22
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